- Diario sobre as observações feitas nas plantas, que se recolheram no rio Branco. 12 pags. de fol.
- Diario sobre as observações feitas nas plantas, que se recolheram no rio Madeira. 36 pags. de fol.
- Memoria sobre as palmeiras. 11 pags. de fol.
- Collecção das experiencias de tinturaria, que se fizeram nas viagem de expedição philosophica pelo rio Negro, com doze amostras de tinta em lã.
- Relação dos preparos necessarios à expedição philosophica que executou, os quaes pediu em 1786. 36 pags. de fol.
- Papeis avulsos de memorias e escriptos pertencentes á viagem, etc, 1840 pags, de fal. e 428 pags. in-4.º
- Oração latina por occazião dos annos do serenissimo senhor dom José, principe do Brazil, feita em 1779.
- Falla que fez para recitar no dia da posse do excellentissimo senhor general do Parà Martinho de Souza e Albuquerque e bispo dom frei Caetano Brandão.
- Falla que fez na noite de 19 de setembro de 1784 ao despedir-se do excellentissimo senhor Martinho de Souza e Albuquerque. 3 pags. de fol.
- Falla que fez na tarde de 2 de março de 1785 ao illustrissimo e excellentissimo senhor João Pereira Caldas, quando entrou a visital-o na villa de Barcellos. 4 pags. de fol.
- Falla que fez o mesmo no dia 4 de agosto de 1785, dia em que fazia annos. 4 pags. de fol.
- Propriedade e posse das terras do Cabo do Norte pela corôa de Portugal em 1792. 47 pags. de fol. - Foi publicada com o titulo:
- Propriedade e posse das terras do Cabo do Norte pela corôa de Portugal, deduzida dos annaes historicos do Estado do Maranhão, e documentos por onde se acham dispersas as suas prova. 1792 - Sahiu no tomo 3.º da Revista do instituto historico, pags. 389 a 421.
- Propriedade e posse de Portugal das terras cedidas aos francezes na margem boreal do rio Amazonas. 1802. 9 pags. de fol.
- Memoria ou parecer sobre a plantação dos olivaes nas terras que na villa de Coruche tinha Joaqtdm Rodrigues Botelho - Desta obra ha noticia no caderno das memorias particulares do doutor Alexandre Ferreira, do anno de 1783.
- Memoria sobre as matas de Portugal, dividida em tres partes e lida na academia real das sciencias no anno de 1780. 82 pags. in 4.º
- Abuso da Conchyliologia em Lisboa etc. 1781. 86 pags. in 4º - Foi tambem lida na academia real das sciencias.
- Descripção de uma planta desconhecida pelo cirurgião-mór do regimento de Alcantara. 41 pags. in 4º - Diz o autor da Noticia destes
